El programa de Doctorado en Ciencias en Biotecnología (DCB) es un programa multisede con la participación de 6 unidades académicas ubicadas en 5 entidades federativas, en donde el alumno puede desarrollar su trabajo experimental en las seis unidades que lo conforman. El objetivo es formar investigadores que desarrollen la capacidad de trabajar en grupos interdisciplinarios y bajo el marco de proyectos en el área de la biotecnología, agroalimentaria, salud y medio ambiente para la generación de nuevos productos, procesos y servicios.
Este programa fomenta el establecimiento de vínculos de cooperación con otras áreas de docencia e investigación, tanto del IPN como de otras instituciones y organismos.